Obiekty fotograficzne gromadzone w Gdańskiej Galerii Fotografii mają charakter lokalny, regionalny i historyczny. Najliczniej reprezentowane są kolekcje fotografii gdańskiej i kresowej. Ostatnio, dzięki darowiznom artystów, znacznie powiększyła się kolekcja współczesnej polskiej i obcej fotografii artystycznej.
Gdańska Galeria Fotografie nie eksponuje swoich zbiorów na wystawie czasowej.