Dział Historii Medycyny Muzeum Mikołaja Kopernika znajduje się w zespole poszpitalnym św. Ducha. Budynek szpitala wraz z gotycką kaplicą św. Anny pochodzi z pierwszej połowy XV w., budowany był etapami. Jest to jedyny w Polsce zabytek szpitalnictwa, który w niezmienionym kształcie zachował się od początku XVII w. Dziś stał się miejscem ekspozycji zabytków historii medycyny oraz wystaw czasowych związanych z tematyką śmierci, chorób czy cielesności. Tuż przy szpitalu mieści się także ogród zielny (łac. herbularius).